生于肥后小国乡（熊本县小国町）的庄屋之家。
在熊本医学校师从荷兰医生曼斯费尔特，立志从医。
从东京大学医学部毕业，进入内务省卫生局。
留学德国，在细菌学家科赫门下开始研究。
世界上首次成功实现破伤风菌的纯培养。
发现破伤风的血清疗法，与贝林一起发表。
回国后在福泽谕吉等人的帮助下创办传染病研究所。
前往鼠疫流行的香港，发现了鼠疫杆菌。
反对研究所被移交给其他政府部门而辞职，新创办了北里研究所。
担任庆应义塾大学医学部首任学部长。
在东京去世。
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内容基于教科书和传记中可以确认的史实，不确定之处会注明。