作为黑田孝高（官兵卫）的长子生于播磨（兵库县）姬路，幼名松寿丸。父亲官兵卫后来作为丰臣秀吉的军师而闻名。
作为父亲效忠织田信长的凭证，他被送去做人质，在秀吉的城下近江（滋贺县）长滨长大。据说秀吉之妻宁宁很疼爱他。
父亲官兵卫前往有冈城劝说背叛信长的荒木村重，却被扣押。信长怀疑迟迟不归的官兵卫已经背叛，下令处死松寿丸，竹中重治（半兵卫）暗中将他藏匿，救了他一命。
他随父亲参加秀吉的九州征伐，立下战功。父亲获封丰前（福冈县东部、大分县北部）的中津，长政也致力于平定领内的一揆、整顿城下町。
父亲隐居，他继承家督成为中津城主。他除了继承父亲的智慧，还以勇猛的作战而闻名。
在秀吉出兵朝鲜的文禄之役中，他率军渡海到朝鲜半岛。庆长之役时再次出征，在艰苦的战斗中参与了许多战役。从这时起，他与石田三成等人的对立日益加深。
关原之战中他加入德川家康的东军。他不仅在战场上奋战，还策动小早川秀秋、吉川广家等人削弱西军，为东军的胜利作出巨大贡献。因此功被封筑前（福冈县）52万余石。
他开始在博多附近修筑新城，以黑田家渊源之地备前福冈（冈山县）命名为「福冈」。城池和城下町用了约七年建成，与商人之城博多一起，成为今天福冈市的基础。
父亲官兵卫（如水）去世。长政珍视父亲的教诲，后来为子孙和家臣写下了守护家业的心得。
大坂冬之阵时他奉命留守江户，大坂夏之阵则作为德川方出征。据说由他命人绘制的「大坂夏之阵图屏风」，以连被卷入战火、四处逃难的百姓都描绘出来而闻名。
他随将军家上洛前往京都，在当地的报恩寺病逝。临终前他给家臣留下遗言，福冈藩此后一直由黑田家传承到明治时代。
织田信长丰臣秀吉德川家康竹中重治（半兵卫）黑田孝高（官兵卫）石田三成小早川秀秋蜂须贺正胜
大谷吉继伊达政宗真田幸村（信繁）立花宗茂淀殿伊东满所支仓常长宇喜多秀家
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