仙台で、武士の家に生まれた。のちに母の実家の志賀家の養子となった。
東京帝国大学の医科を卒業し、北里柴三郎の伝染病研究所に入った。
多くの人が命を落としていた赤痢の原因となる菌を発見した。菌の学名には志賀の名がつけられている。
ドイツに留学し、エールリヒのもとで薬で病気を治す研究をした。
日本に帰り、研究を続けた。
朝鮮の京城（ソウル）の医学校の校長となり、のちに京城帝国大学の総長となった。
文化勲章を受けた。
宮城県で亡くなった。
尾崎紅葉横山大観秋山真之北村透谷国木田独歩幸徳秋水樋口一葉島崎藤村
教科書や伝記で確かめられる事実をもとにしています。不確かなことは「諸説あり」「と伝わる」としています。